Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00526Q96FQ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00526Q96FQ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms