Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC97Q96F63 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms