Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MALSU1Q96EH3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MALSU1Q96EH3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MALSU1Q96EH3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms