Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUS1Q96E22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 603.7 ms