Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VWCEQ96DN2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VWCEQ96DN2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWCEQ96DN2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms