Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RMDN1Q96DB5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms