Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLCD1Q96CP7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD1Q96CP7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD1Q96CP7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms