Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NSUN4Q96CB9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NSUN4Q96CB9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms