Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC17Q96AE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms