Protein–RNA interactions for Protein: Q92858

ATOH1, Protein atonal homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH1Q92858 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATOH1Q92858 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATOH1Q92858 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATOH1Q92858 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATOH1Q92858 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATOH1Q92858 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATOH1Q92858 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATOH1Q92858 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATOH1Q92858 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATOH1Q92858 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATOH1Q92858 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms