Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT35Q92764 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT35Q92764 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms