Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 NPT1YOR209C 1290 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 FRE6YLL051C 2139 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1B-ORQ92393 VPS5YOR069W 2028 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 FAP1YNL023C 2898 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 CDC43YGL155W 1131 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 HXT4YHR092C 1731 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 SPR6YER115C 576 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 YGL088WYGL088W 366 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 FUN19YAL034C 1242 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 URE2YNL229C 1065 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 SKY1YMR216C 2229 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 FOL1YNL256W 2475 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 KNS1YLL019C 2214 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 UBC8YEL012W 657 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 LEM3YNL323W 1245 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 SSH4YKL124W 1740 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 GLN3YER040W 2193 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 ARF2YDL137W 546 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 TIP41YPR040W 1071 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 HIR2YOR038C 2628 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 SKG3YLR187W 3081 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 HAS1YMR290C 1518 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 ABF1YKL112W 2196 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 RHO2YNL090W 579 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 KEX2YNL238W 2445 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 GLO2YDR272W 825 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 MNN4YKL201C 3537 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 RCK1YGL158W 1539 nt7.46□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 DPB4YDR121W 591 nt7.46□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 CTR2YHR175W 570 nt7.46□□□□□ -1.21
TY1B-ORQ92393 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 FRT2YAL028W 1587 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 SNT2YGL131C 4212 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 CEF1YMR213W 1773 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 YPL199CYPL199C 723 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 MRI1YPR118W 1236 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 PDC1YLR044C 1692 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 SAP4YGL229C 2457 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 ICL2YPR006C 1728 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 AIF1YNR074C 1137 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 GPA1YHR005C 1419 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 RTC1YOL138C 4026 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 SAP30YMR263W 606 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 GSP2YOR185C 663 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 UMP1YBR173C 447 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 YJR124CYJR124C 1347 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 BRF1YGR246C 1791 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 CEG1YGL130W 1380 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 PIC2YER053C 903 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 NQM1YGR043C 1002 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 YBL070CYBL070C 321 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 GMC1YDR506C 1827 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-ORQ92393 ALD3YMR169C 1521 nt7.4□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 ALD2YMR170C 1521 nt7.4□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 RPL7AYGL076C 735 nt7.4□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 RPL7BYPL198W 735 nt7.4□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 ISU2YOR226C 471 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 YGR066CYGR066C 879 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 ICY2YPL250C 411 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 YPL278CYPL278C 303 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 NHP6BYBR089C-A 300 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 SDA1YGR245C 2304 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 NOP58YOR310C 1536 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 RIA1YNL163C 3333 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 IWR1YDL115C 1062 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 YGL152CYGL152C 678 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 YGP1YNL160W 1065 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 GRS1YBR121C 2004 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 YFL034WYFL034W 3222 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 YDL012CYDL012C 324 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 CHO1YER026C 831 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 CTS1YLR286C 1689 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 HPF1YOL155C 2904 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 NMD4YLR363C 657 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 SLZ1YNL196C 897 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 MTW1YAL034W-A 870 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 MRPL15YLR312W-A 762 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 ASK10YGR097W 3441 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 ACO1YLR304C 2337 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 XPT1YJR133W 630 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 YFL042CYFL042C 2025 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 BPL1YDL141W 2073 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1B-ORQ92393 AIR2YDL175C 1035 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 RPA49YNL248C 1248 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 BUD9YGR041W 1644 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 MRPL20YKR085C 588 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 YNL181WYNL181W 1224 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 BSC5YNR069C 1470 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 THI5YFL058W 1023 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 HOR7YMR251W-A 180 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 THI12YNL332W 1023 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 FUM1YPL262W 1467 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 ZUO1YGR285C 1302 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 COP1YDL145C 3606 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 IMA2YOL157C 1770 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 TMA17YDL110C 453 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 RPL19AYBR084C-A 570 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 RRP40YOL142W 723 nt7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.2 ms