Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG4AQ8WYN0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms