Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNAAF4Q8WXU2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DNAAF4Q8WXU2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DNAAF4Q8WXU2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms