Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBLCP1Q8WVY7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBLCP1Q8WVY7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms