Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYRIPQ8NFW9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYRIPQ8NFW9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms