Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC112Q8NEF3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC112Q8NEF3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms