Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD1Q8NBU5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD1Q8NBU5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms