Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C17orf53Q8N3J3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C17orf53Q8N3J3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms