Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 RFX2-223ENST00000592883 589 ntTSL 414.54□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 32.8
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AGGF1Q8N302 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 32.7
AGGF1Q8N302 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 32.7
AGGF1Q8N302 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 32.7
AGGF1Q8N302 SLC13A5-201ENST00000293800 3176 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 32.7
AGGF1Q8N302 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 32.7
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AGGF1Q8N302 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.054e-9■■■■■ 32.6
AGGF1Q8N302 TTC38-203ENST00000421359 821 ntTSL 414.7□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 32.6
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AGGF1Q8N302 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.964e-9■■■■■ 32.6
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AGGF1Q8N302 PPP1R7-211ENST00000438799 976 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 32.6
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AGGF1Q8N302 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 32.6
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AGGF1Q8N302 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.536e-9■■■■■ 31.7
AGGF1Q8N302 DAPK1-212ENST00000489291 4334 ntTSL 1 (best)9.97□□□□□ -0.816e-9■■■■■ 31.7
AGGF1Q8N302 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 31.6
AGGF1Q8N302 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 08e-9■■■■■ 31.6
AGGF1Q8N302 GPATCH4-201ENST00000368232 1972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.718e-9■■■■■ 31.6
AGGF1Q8N302 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 49.17□□□□□ -0.948e-9■■■■■ 31.6
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AGGF1Q8N302 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.032e-8■■■■■ 31.6
AGGF1Q8N302 TTC7A-206ENST00000441914 2418 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 31.6
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AGGF1Q8N302 TTC7A-209ENST00000484061 3085 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 31.6
AGGF1Q8N302 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 31.6
AGGF1Q8N302 TTC7A-204ENST00000409825 4739 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 31.6
AGGF1Q8N302 TTC7A-208ENST00000474321 622 ntTSL 514.16□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 31.6
AGGF1Q8N302 TTC7A-211ENST00000491786 3615 ntTSL 1 (best)12.06□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 31.6
AGGF1Q8N302 PPP1R12C-203ENST00000586197 472 ntTSL 514.77□□□□□ -0.056e-11■■■■■ 31.5
AGGF1Q8N302 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.864e-13■■■■■ 31.5
AGGF1Q8N302 SIGMAR1-204ENST00000461426 939 ntTSL 1 (best)26■■□□□ 1.754e-13■■■■■ 31.5
AGGF1Q8N302 P2RX1-203ENST00000572418 2945 ntTSL 214.76□□□□□ -0.052e-10■■■■■ 31.5
AGGF1Q8N302 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-10■■■■■ 31.5
AGGF1Q8N302 KIAA0895L-211ENST00000568563 1977 ntTSL 519.23■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 31.4
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