Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLF2Q8IX21 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLF2Q8IX21 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLF2Q8IX21 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms