Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGDCC3Q8IVU1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGDCC3Q8IVU1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGDCC3Q8IVU1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms