Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC29A4Q7RTT9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC29A4Q7RTT9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC29A4Q7RTT9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms