Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRADAQ7RTN6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRADAQ7RTN6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRADAQ7RTN6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRADAQ7RTN6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRADAQ7RTN6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRADAQ7RTN6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRADAQ7RTN6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRADAQ7RTN6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms