Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARCQ7LC44 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCQ7LC44 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARCQ7LC44 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARCQ7LC44 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms