Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYDE1Q6ZW31 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYDE1Q6ZW31 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms