Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAPN12Q6ZSI9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN12Q6ZSI9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms