Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRCAPQ6ZRS2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SRCAPQ6ZRS2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRCAPQ6ZRS2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms