Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00114Q6XXX2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00114Q6XXX2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms