Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00575Q6W349 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00575Q6W349 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms