Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN9

PSRC1, Proline/serine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSRC1Q6PGN9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSRC1Q6PGN9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSRC1Q6PGN9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms