Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CSAG1Q6PB30 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CSAG1Q6PB30 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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