Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD54Q6NXT1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD54Q6NXT1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD54Q6NXT1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD54Q6NXT1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms