Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP3Q6NUK4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP3Q6NUK4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms