Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2Q6NTF9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDD2Q6NTF9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHBDD2Q6NTF9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms