Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRNP1Q6NT89 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRNP1Q6NT89 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRNP1Q6NT89 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRNP1Q6NT89 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms