Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDE2Q6IQ49 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms