Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL2Q6F5E8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CARMIL2Q6F5E8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CARMIL2Q6F5E8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CARMIL2Q6F5E8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms