Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TNS3Q68CZ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNS3Q68CZ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNS3Q68CZ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNS3Q68CZ2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms