Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM208BQ5VWN6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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