Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF3Q5VWG9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF3Q5VWG9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF3Q5VWG9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms