Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYDE2Q5VT97 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms