Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C12orf60Q5U649 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C12orf60Q5U649 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C12orf60Q5U649 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms