Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFFO2Q5TF58 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFFO2Q5TF58 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFFO2Q5TF58 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms