Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf220Q5T0J3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf220Q5T0J3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf220Q5T0J3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms