Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CMPK2Q5EBM0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMPK2Q5EBM0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.8 ms