Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALFQ53S48 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ALFQ53S48 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ALFQ53S48 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms