Protein–RNA interactions for Protein: Q53FP2

TMEM35A, Transmembrane protein 35A, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35AQ53FP2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM35AQ53FP2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM35AQ53FP2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35AQ53FP2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms