Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC57Q2TAC2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC57Q2TAC2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC57Q2TAC2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms