Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDR2Q16832 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDR2Q16832 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms